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qPCR Module
CCK8 Module
CTG Module
WB Module
Base Process Module
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qPCR 分析模块使用教程
1. 原始数据预处理：
使用“ Design & Analysis 2.4 ”( 点击下载 )软件打开qPCR的下机数据文件(.eds格式)，例如：“qPCR_demo.eds”，
依次点击“Analyze”-> “Actions: Export...”，在Export Plate中勾选“Combined all reports in one file”， 最后点击“Export”，将导出的文件直接上传至qPCR网页分析模块中，开始分析。
2.上传文件并分析:
上传预处理后得到的表格文件，设置好各种参数后，点击“Submit & Calculate”按钮即可开始分析和绘图。
3.查看和下载结果：
“RawData”中可以查看原始数据;
“SelectData”中可以查看所选择的要分析的数据;
“QualityControl”中可以查看和下载amplification plot和Melt Curve plot;
“Result”中可以下载结果表格，后续可以在GraphPad中进行绘图和统计分析;
“Plot”中可以查看和下载本次qPCR的结果图（两种风格）。
“点击图片或表格上方的下载按钮可直接下载该图片或表格。
下载图片的宽度和高度可以在左侧工具栏中设置， 设置好不用每次都点击“Submit & Calculate” 。 其中PDF为矢量图，可以在adobe illustrator中对文字、颜色等进行编辑；PNG为位图，可以放在PPT中进行汇报。 下载的表格为csv文件（逗号分隔符表格），可以按照Excel的方式打开。
CCK8 分析模块使用教程
1. 原始数据预处理：
需要将下机数据手动处理成如下图的格式：
其中， 第一列 为样本名，其余均为该样本所对应的OD值，例如上图中做了5个重复。
同一次测的数据放在一个子表中，子表的名称不重要，但排列顺序决定了网页分析是读入的顺序。例如上表中的Sheet1, Sheet2, Sheet3, Sheet4, Sheet5, Sheet6在分析时会被重命名为D0, D1, D2, D3, D4, D5。 blank在哪个子表中无所谓，但需至少在一个子表含有。
2.上传文件并分析：
上传预处理后得到的表格文件，设置好各种参数后，点击“Submit & Calculate”按钮即可开始分析和绘图。
3.查看和下载结果：
“RawData”中可以查看原始数据;
“SelectData”中可以查看所选择的要分析的数据;
“Result”中可以查看过滤后的，减去blank均值的结果，下载后可以在GraphPad中进行绘图和统计学分析;
“Summary”中为各样本每天所测数据的均值和标准差;
“Plot”中可以查看和下载本次qPCR的结果图（两种风格）。
“点击图片或表格上方的下载按钮可直接下载该图片或表格。
下载图片的宽度和高度可以在左侧工具栏中设置， 设置好不用每次都点击“Submit & Calculate” 。 其中PDF为矢量图，可以在adobe illustrator中对文字、颜色等进行编辑；PNG为位图，可以放在PPT中进行汇报。 下载的表格为csv文件（逗号分隔符表格），可以按照Excel的方式打开。
CTG 分析模块使用教程
1. 原始数据预处理：
将CTG的下机数据按照下图中的格式处理，
第一行第二列 （B1）为样本名， 第一列 为一系列药物浓度和对照组（这里是DMSO）， 每组可以有多个重复（上图中为3个重复），每个样本占一个子表。若有多个样本，可以新建多个子表。
2. 上传数据并分析：
上传数据并设置好参数后点击“Submit & Calculate”按钮，进行分析和绘图。
3.结果查看和下载：
“RawData”中为上传的原始数据；
“SelectData”中为所选择的要分析的数据；
“Result”中可以查看过滤后的，除以blank均值后得到的细胞活率，下载后可以在GraphPad中进行绘图和统计学分析；
“Summary”中为各样本的IC50和标准差；
“Heatmap”中为细胞活率的热图。热图的颜色和图例的颜色可以在上方的栏目中进行选择。 下载热图的宽度和高度可以在左侧工具栏中设置， 设置好不用每次都点击“Submit & Calculate”，直接点击图片上方Download即可 。
“Plot”中数据的实际值绘图和拟合图。
“点击图片或表格上方的下载按钮可直接下载该图片或表格。
下载图片的宽度和高度可以在左侧工具栏中设置， 设置好不用每次都点击“Submit & Calculate” 。 其中PDF为矢量图，可以在adobe illustrator中对文字、颜色等进行编辑；PNG为位图，可以放在PPT中进行汇报。 下载的表格为csv文件（逗号分隔符表格），可以按照Excel的方式打开。
WB 分析模块使用教程
1. 原始数据预处理：
将WB膜的曝光结果使用ImageJ 等软件计算条带灰度值，然后整理为上图所示的表格格式。
第一列 为样本名， 第一行 为所检测的蛋白名，数值为ImageJ软件得到的每个条带的灰度值。 每个子表代表一次实验 。 上图中有3个子表，代表3次重复实验。（该demo数据为随机生成的演示数据，切勿根据该演示数据设计自己的实验！！！）
2. 上传数据并分析：
上传数据并设置好参数后点击“Submit & Calculate”按钮，进行分析和绘图。
3. 结果查看和下载：
“RawData”中为上传的原始数据；
“SelectData”中为所选择的要分析的数据；
“Result”中可以查看过滤后的相对蛋白表达量（相对于内参和对照组），下载后可以在GraphPad中进行绘图和统计学分析；
“Summary”中为各样本的均值和标准差；
“Plot”中蛋白相对表达数据的绘图。
“点击图片或表格上方的下载按钮可直接下载该图片或表格。
下载图片的宽度和高度可以在左侧工具栏中设置， 设置好不用每次都点击“Submit & Calculate” 。 其中PDF为矢量图，可以在adobe illustrator中对文字、颜色等进行编辑；PNG为位图，可以放在PPT中进行汇报。 下载的表格为csv文件（逗号分隔符表格），可以按照Excel的方式打开。
Base Process 模块使用教程
在相应文本框中输入碱基序列后点击“Submit & Calculate”按钮进行相应功能的实现。
注意：DNA序列中仅允许包括“ATCGNatcgn”，RNA序列中仅允许包括“AUCGNaucgn”，输入以外的字母则会在结果中显示“Input error!”
结果示例：
其中上方红色框中为输入序列，下方橙色框中为输出的结果。
1. Design and Analysis
https://pan.baidu.com/s/1JD5m1xHGZlA-2p52B6GgfQ?pwd=5lex
2. qPCR demo data
qPCR_demo.eds qPCR_demo.xlsx3. CCK8 demo data
CCK8_demo.xlsx4. CTG demo data
CTG_demo.xlsx5. WB demo data
WB_demo.xlsx